商儒构建了研究院、战略发展与共创中心、总部事业部、运营中心、共享中心“五位一体” 的运营机制，形成了高效、灵动、协同的项目服务模式，并逐步拥有了一支融合东西方教育背景，集“战略思维、历史思维、系统思维、创新思维、底线思维”于一身，既懂研究又会运营的复合型高素质专业化人才队伍，有效帮助组织解决培训课题选择难、邀请专家难、组织学员难、教学管理难等问题，确保为客户提供高品质的服务。
根植中国本土实践，整合全球优势资源，本着“立足本土，融贯中西；知行合一，经世致用”的学术理念，重点开展基础研究、案例研究与课题研究，致力于提炼中国管理思想与工具，总结中国企业领先之道，构建中国企业发展智库，为公司持续成长提供智慧源泉与学术支撑，为中国企业高质量“走出去”、塑造具有全球竞争力的世界一流企业，提供知识服务与智力支持。
总部事业部立足北京，辐射全国，基于知识服务全产业链的锻造，从战略伙伴关系建立、战略资源整合、战略模式创新三个维度，充分发挥“资源配置中心”与“价值服务中心”两大核心职能，不断提升资源配置市场化能力，对商儒高质量发展起着战略引领与总部“火车头”作用。同时，为推动全国各区域中心与客户建立全面战略合作关系提供坚实保障。
作为商儒高质量发展的“领头雁”部门，战略发展与共创中心隶属董事会，由董事会直接领导，是商儒面向未来塑造新能力、探寻新增长点、打造新优势的关键部门。中心聚焦战略研究、战略规划、战略管理三大职能，保障公司战略与文化的高效落地实施，同时依托学术、资源、品牌、经验等优势，不断优化公司系统集成能力与核心竞争力，促进各中心的高效协同发展，加深与核心客户的战略合作关系，推动业务模式的变革与企业转型升级，确保公司战略目标实现。
运营中心基于公司的“五位一体”运行机制，充分发挥平台学术、品牌、资源、经验等优势，负责所在区域的客户开拓、关系维护与市场结构完善，为客户提供基于知识服务全产业链的“1+N”高质量学习服务，并不断挖掘客户需求、引领客户需求、探索创新合作模式，打造“专、精、深”的知识服务创值中心，以高质量学习推动当地企业高质量发展。
DECAF教学运营中心是商儒开展高质量学习服务的关键支撑力量，凭借自主研发的DECAF教学管理体系、严格的全流程教学质量管控体系、完善的教学评估体系、专业的教学服务团队、20年5000余个项目实践经验、创新的教学服务产品与模式、成熟的教学服务人才培养模式，充分发挥研发驱动、成本创新和规模定制优势，一方面为公司内外部提供量身定制、降本增效的高质量教学管理服务，另一方面对外直接输送专业化教学服务人才，已经成为一家融教学研究、教学实施、教学质量管理、教学资源运营、人才培养及输出服务为一体的专业化教学运营服务机构。
财务共享中心主要负责业务“下沉”到各中心，辅助其进行财务核算与分析，致力于打造以市场视角为内外部客户提供专业服务的战略型财务管控体系。不断完善财务管理流程与制度，强化预算管理与成本控制，提高资金统筹与运营能力，提升财务分析对公司战略决策的支撑作用，在打牢财务管理基础能力的同时，提高公司风险控制能力与资本运营能力，实现公司价值最大化，促使公司在生命周期内追求价值的持续增长，具有长期性、可持续发展性。
组织人事中心立足公司战略，强调组织发展与人才发展同步、个人新能力建设与组织新能力建设相互促进、相互融合。强化党建引领，聚焦支部建设、组织优化、文化宣贯、组织学习、绩效管理、薪酬激励、人才“筛、察、选、拔、用”培养管理配套机制建设，全面推动公司组织变革、制度流程优化、人才队伍建设与企业文化建设，党建与业务融合，充分激发和释放人才创新创造活力，促进人才全面发展，为商儒高质量发展提供坚强的人才保障、组织保障、制度保障与文化保障，进而实现既“强人”又“强企”。
品牌数据信息中心以塑造具有全球竞争力的学习生态品牌为重点，建设具有学术影响力的中国企业发展智库为核心，推动公司战略、机制、文化、学术成果等在内外部的宣贯落地，促进上下战略行动、文化理念、品牌形象保持一致性，并不断提高数据信息的应用转化率，激活商儒的数据要素潜能，实现价值链各相关环节的价值动态整合和整体效益提升，为商儒高质量发展提供数字与品牌“双赋能”。